Durante un viaggio di piacere nelle rovine dell’antica Grecia Alman di Thule, anziano uomo d’affari di Nuova Luxor, si imbatte in un uomo moribondo che tiene con sé una neonata e uno scrigno dorato, l’uomo affida la bambina e lo scrigno ad Alman e prima di morire gli confida che la bambina è la reincarnazione della dea Atena e dovrà proteggere la Terra con l’aiuto dei Cavalieri dello Zodiaco, schiera di guerrieri a lei devoti. L’anziano uomo promette Micene di prendersi cura della bambina e di ricomporre la schiera di Cavalieri dello Zodiaco.

Sono passati 6 anni da quando 10 bambini sono partiti per recuperare le vestigia e Lady Isabell, nipote di Alman di Thule ormai deceduto, indice la Guerra Galattica, torneo tra i Cavalieri dello Zodiaco, mettendo in palio la Sacra Armatura. Pegasus vince la sacra armatura di Pegasus battendo Cassios nel duello decisivo, tornato a Nuovaa Luxor il giovane scopre che la sorella è scomparsa da diversi anni ormai e, anche se controvoglia, decide di accettare di partecipare alla Guerra Galattica. Alla Guerra Galattica Pegasus si mette subito in mostra battendo Geky dell’Orsa, come lui anche il glaciale Crystal il Cigno vince senza problemi contro Aspides dell’Idra e si prepara ad affrontare il vincente dello scontro tra Pegasus e Sirio il Dragone. Lo scontro tra i due cavalieri è cruento e senza esclusione di colpi e durante lo scontro le armature dei due cavalieri riportano danni irreparabili tanto da costringerli a combattere senza armature, lo scontro lo vince Pegasus ma tutti e due i cavalieri subiscono gravi ferite con Sirio che rischia la vita, viene salvato dallo stesso Pegasus. Durante lo scontro tra Andromeda e Asher dell’Unicorno fa la sua comparsa l’ultimo cavaliere mancante, Phoenix. Il cavaliere della Fenice non è tornato per prendere parte al torneo ma bensì per rubare la sacra armatura con l’aiuto dei suoi cavalieri e per far ciò non ha remore nel colpire suo fratello Andromeda. Pegasus, Sirio, Crystal e Andromeda si mettono alla caccia di Phoenix e della Sacra Armatura riuscendo a recuperare solo 4 dei 9 pezzi totali. Vista l’emergenza Sirio decide di partire per lo Jamir per portare a riparare le armature sua e di Pegasus che nel frattempo viene sfidato insieme ai suoi compagni da Phoenix e dai 4 cavalieri neri. Nello Jamir Sirio incontra colui che ripara le armature, il Grande Mur che decide di riparare le armature a patto che Sirio sia disposto a versare la metà del suo sangue, il cavaliere accetta di sacrificarsi e così salva le due armature mentre lui è salvato dal Grande Mur. Pegasus e compagni riescono ad avere la meglio su Phoenix e sui suoi cavalieri, il cavaliere della Fenice, poi, racconta ai suoi amici i difficili anni vissuti sull’isola della Regina Nera che lo hanno portato a cambiare in questo modo, dopo qualche minuto i cavalieri vengono attaccati da Docrates, l’attacco provoca la scomparsa di Phoenix e la perdita di 8 parti della Sacra Armatura. I cavalieri riescono a battere Docrates ma non riescono a recuperare le parti mancanti, i cavalieri riescono, però, a difendere l’elmo dall’attacco degli altri sicari mandati da Arles e nel frattempo fa il suo ritorno Phoenix che si riunisce finalmente ai Cavalieri dello Zodiaco. Arles decide di affidarsi ai cavalieri d’argento e invia Eris della Lucertola che viene sconfitto da Pegasus dopo un duro scontro e dopo è il turno di Moses della Balena e Asterione dei Cani da Caccia, durante lo scontro tra Babel e Crystal fanno la loro comparsa i cavalieri d’acciaio che intervengono in aiuto dei cavalieri di Atena che nel frattempo si rivela con grande stupore di tutti in Lady Isabel. Durante lo scontro tra Argol di Perseo e Sirio quest’ultimo si acceca per battere l’avversario e salvare Pegasus e Andromeda che sono stati pietrificati dal cavaliere d’argento, in suo aiuto intervengono ancora i cavalieri d’acciaio che danno un aiuto decisivo. Dopo lo scontro con Argol Sirio è costretto ad un periodo di riposo forzato ai 5 Picchi mentre Pegasus e compagni continuano a difendere l’elmo dagli attacchi degli altri cavalieri d’argento. Durante lo scontro con Ioria, Cavaliere d’Oro del Leone, inviato da Arles Pegasus indossa la Sacra Armatura del Sagittario, Lady Isabel interviene e interrompe lo scontro mostrando a Ioria la sua vera identità. Una volta al cospetto di Arles Ioria lo smaschera ma rimane vittima del suo colpo del controllo della mente e ritornerà normale solo dopo aver ucciso un nemico. A Nuova Luxor Lady Isabel e i cavalieri decidono di recarsi in Grecia per attaccare il Grande Tempio e lì ritrovano Sirio che nel frattempo ha recuperato parzialmente, prima di iniziare il viaggio verso le dodici case Lady Isabel rimane vittima dell’attentato di Betelgeuse che la colpisce con una freccia che solo il Grande Sacerdote può togliere entro 12 ore. Alla prima casa i cavalieri trovano il Grande Mur, cavaliere d’oro dell’Ariete che decide di riparare le loro armature e spiega loro l’importanza di raggiungere il settimo senso che è il cosmo ultimo di un cavaliere. Alla seconda casa Pegasus affronta il cavaliere del Toro, durante lo scontro Pegasus è sul punto di mollare ma proprio in quel momento riesce a raggiungere il settimo senso così da riuscire a combattere alla pari con l’avversario e riuscire a vincere lo scontro dopo avergli rotto uno dei due corni. Alla casa dei Gemelli i cavalieri sono vittima del labirinto dei Gemelli, Pegasus e Sirio riescono a passare oltre mentre Crystal e Andromeda sono impegnati in una dura lotta contro l’illusione di Gemini che spedisce Crystal nella dimensione oscura mentre Andromeda si salva grazie alla sua catena e riesce a passare oltre. Crystal, dopo essere stato inghiottito dalla dimensione oscura, si ritrova nella settima casa della Bilancia dove vi trova Acquarius, maestro delle energie fredde, contro il quale Crystal non riesce a combattere così dopo aver subito il “Sacro Acquarius” viene imprigionato in una teca di cristallo. Pegasus e Sirio giungono alla quarta casa ma solo Sirio si ferma a combattere contro Cancer mentre Pegasus continua la sua corsa. Durante lo scontro Sirio viene mandato nella valle della Morte dove vede lo spirito di Crystal che si dirige verso la bocca di Ade, tenta di fermarlo ma invano, durante la battaglia Cancer con il suo cosmo fa del male a Fiore di Luna scatenando la furia di Sirio che così riesce a vincere lo scontro. Alla quinta casa Pegasus raggiunge Ioria che però è vittima del colpo di Arles e quindi non esita a colpirlo, durante lo scontro giunge Cassios che per amore di Tisifone decide di sacrificarsi al posto di Pegasus per permettere a Ioria di tornare in se. Superato lo scoglio della quinta casa i cavalieri raggiungono la casa della Vergine, il cavaliere d’oro di Virgo è il cavaliere più vicino ad Atena e quindi l’esito dello scontro tra Virgo e i tre cavalieri è a favore del cavaliere d’oro fin quando sul campo di battaglia non fa la sua comparsa Phoenix che riesce a raggiungere il settimo senso solo dopo aver subito il Sacro Virgo, una volta padrone del settimo senso Phoenix riesce a battere Virgo ma a costo della sua stessa vita. Alla settima casa i cavalieri trovano il feretro di ghiaccio nel quale è intrappolato Crystal, è Sirio a liberare l’amico con l’aiuto dell’armatura d’oro della Bilancia e mentre Andromeda si offre di aiutare l’amico Pegasus e Sirio proseguono e si trovano di fronte a Scorpio che subito trafigge i due cavalieri con alcune delle sue punture velenose poi l’arrivo di Crystal, che nel frattempo si è ripreso, permette ai suoi compagni di avanzare mentre lui combatte con Scorpio che dopo uno scontro intenso decide di lasciarlo passare. Alla casa del Sagittario tutti i cavalieri vengono messi alla prova dallo spirito di Micene che lascia loro un incisione sul muro nella quale affida a Pegasus e compagni la vita della dea Atena. Passata con commozione la casa del Sagittario i cavalieri si apprestano a passare le ultime case, nella decima è Sirio a sfidare Capricorn, il cavaliere d’oro che custodisce nel suo braccio la sacra spada Excaliburg donatagli dalla dea Atena, lo scontro è impari ed infatti il Dragone vede cadere a pezzi tutta la corazza del Dragon. Sirio è costretto raggiungere la “Pienezza del Dragone”, ovvero il raggiungimento del cosmo ultimo del cavaliere del Dragone, che permette a Sirio di avere la meglio sparendo in cielo con l’avversario. Giunti all’undicesima casa Pegasus e Andromeda lasciano Crystal solo contro Acquarius, lo scontro è più equilibrato del precedente e Crystal riesce a raggiungere lo zero assoluto prima di Acquarius e riesce a batterlo rimanendo esanime a terra. Alla dodicesima Casa Andromeda si offre ad affrontare Fish, cavaliere d’oro dei Pesci che usa le rose come armi e attacca Andromeda con le rose velenose ma il cavaliere di Atena decide di usare tutto il suo potere espandendo al massimo il suo cosmo e riesce così a sconfiggerlo ma rimane vittima della “Rosa Bianca” di Fish. Dopo aver attraversato una scalinata di rose velenose Pegasus giunge di fronte ad Arles essi si rivela essere il cavaliere d’oro dei Gemelli e nella sua personalità buona spiega a Pegasus come salvare Atena, Pegasus si appresta a raggiungere la statua di Atena ma viene attaccato da Arles ma in suo soccorso giunge Phoenix che è ritornato grazie all’aiuto di Virgo e combatte Arles mentre Pegasus, ormai privo dei cinque sensi, riesce a raggiungere la statua di Atena e con lo scudo salva Lady Isabel che dopo essersi ripresa attraversa le dodici case accompagnata dai Cavalieri d’Oro e aiuta a riprendersi Sirio, Crystal e Andromeda. Giunti tutti al cospetto di Arles Pegasus con l’aiuto di Sirio, Crystal, Phoenix e Andromeda riesce scagliare il colpo decisivo ad Arles che però muore colpendosi con lo scettro di Atena durante un attimo in cui la sua parte buona ha la meglio su quella malvagia ponendo così fine alla battaglia